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<!DOCTYPE html>

<title>Flavobacterium bomense</title>

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<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading"><i>Flavobacterium bomense</i></h1>

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/* end https://de.wikipedia.org/ */

</style>

<th><i>Flavobacterium bomense</i>

</th></tr>

<tr>

<th><a href="Systematik_(Biologie)" title="Systematik (Biologie)">Systematik</a>

</th></tr>

<tr>

<td>

<td><i><a href="Abteilung_(Biologie)" title="Abteilung (Biologie)">Abteilung</a>:</i>

</td>

<td><a href="Bacteroidota" title="Bacteroidota">Bacteroidota</a>

</td></tr>

<tr>

<td><i><a href="Klasse_(Biologie)" title="Klasse (Biologie)">Klasse</a>:</i>

</td>

<td><a href="Flavobacteriia" class="mw-redirect" title="Flavobacteriia">Flavobacteriia</a>

</td></tr>

<tr>

<td><i><a href="Ordnung_(Biologie)" title="Ordnung (Biologie)">Ordnung</a>:</i>

</td>

<td><a href="Flavobacteriales" title="Flavobacteriales">Flavobacteriales</a>

</td></tr>

<tr>

<td><i><a href="Familie_(Biologie)" title="Familie (Biologie)">Familie</a>:</i>

</td>

<td><a href="Flavobacteriaceae" title="Flavobacteriaceae">Flavobacteriaceae</a>

</td></tr>

<tr>

<td><i><a href="Gattung_(Biologie)" title="Gattung (Biologie)">Gattung</a>:</i>

</td>

<td><a href="Flavobacterium" title="Flavobacterium"><i>Flavobacterium</i></a>

</td></tr>

<tr>

</td>

<td><i>Flavobacterium bomense</i>

</td></tr>

</tbody></table>

</td></tr>

<tr>

<th><a href="Nomenklatur_(Biologie)" title="Nomenklatur (Biologie)">Wissenschaftlicher Name</a>

</th></tr>

<tr>

<td class="taxo-name"><i>Flavobacterium bomense</i>

</td></tr>

<tr>

<td class="Person">Liu <a href="Et_al." title="Et al.">et al.</a> 2019

</td></tr>

</tbody></table>

<p><i><b>Flavobacterium bomense</b></i> ist eine Art von <a href="Bakterien" title="Bakterien">Bakterien</a>. Es handelt sich um eine kälteliebende (<a href="Psychrophilie" title="Psychrophilie">psychrophile</a>) Art, gefunden wurde sie 2019 auf einem Gletscher in <a href="Tibet" title="Tibet">Tibet</a>.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Erscheinungsbild">Erscheinungsbild</h2></div>

<p>Die Art <i>Flavobacterium bomense</i> ist stäbchenförmig mit einer Größe von 0,32–0,38 × 1,04–2,08 µm. <a href="Kolonie_(Biologie)" title="Kolonie (Biologie)">Kolonien</a> in Hefeextrakt-Pepton-Glucose (Englisch PYG, Peptone Yeast Glucose) zeigen nach 9 Tagen eine kreisförmige, konvexe und ganzrandige Form und eine gelbe Farbe. Die Art ist nicht beweglich, sie besitzt keine <a href="Flagellum" title="Flagellum">Flagellen</a>. <a href="Spore" title="Spore">Sporen</a> werden nicht gebildet.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Stoffwechsel_und_Wachstum">Stoffwechsel und Wachstum</h2></div>

<p><i>Flavobacterium bomense</i> ist <a href="Aerobie" title="Aerobie">aerob</a>, es benötigt Sauerstoff. Der Stoffwechsel ist <a href="Chemotrophie" title="Chemotrophie">chemoorganoheterotroph</a>. Alle untersuchten Stämme können d-<a href="Glucose" title="Glucose">Glucose</a>, d-<a href="Sucrose" class="mw-redirect" title="Sucrose">Sucrose</a>, d-<a href="Maltose" title="Maltose">Maltose</a>, <a href="Glykogen" title="Glykogen">Glykogen</a> und l-<a href="Prolin" title="Prolin">Prolin</a> als alleinige Kohlenstoffquelle nutzen.

</p><p><a href="St%C3%A4rke" title="Stärke">Stärke</a> wird gespalten (<a href="Hydrolyse" title="Hydrolyse">hydrolysiert</a>). Der <a href="Voges-Proskauer-Test" class="mw-redirect" title="Voges-Proskauer-Test">Voges-Proskauer-Test</a> verläuft negativ, ebenso der <a href="Indol-Test" title="Indol-Test">Indol-Test</a>. <a href="Schwefelwasserstoff" title="Schwefelwasserstoff">Schwefelwasserstoff</a> wird nicht produziert. <a href="Harnstoff" title="Harnstoff">Harnstoff</a> wird von der Art nicht gespalten, der <a href="Urease" title="Urease">Urease</a>-Test verläuft also negativ.

</p><p><i>Flavobacterium bomense</i> ist psychrophil (kälteliebend), Wachstum erfolgt bei Temperaturen zwischen 0 und 22 °C, die optimale Temperatur liegt zwischen 10 und 15 °C. Toleriert werden pH-Werte von 6,0 - 9,0. Das Optimum liegt bei pH 7,0. Der <a href="Katalase" title="Katalase">Katalase</a>-Test und der <a href="Oxidase-Test" title="Oxidase-Test">Oxidase-Test</a> verläuft positiv. Tolerierte Salzwerte (Natriumchlorid, NaCl) liegen zwischen 0 und 2,5 %. <a href="Nitrat" class="mw-redirect" title="Nitrat">Nitrat</a> wird nicht zu <a href="Nitrit" class="mw-redirect" title="Nitrit">Nitrit</a> reduziert, es wird von dem Bakterium nicht zur Energiegewinnung genutzt. Der Test auf Hydrolyse von <a href="Gelatine" title="Gelatine">Gelatine</a> und <a href="Casein" class="mw-redirect" title="Casein">Casein</a> verläuft variabel.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Kältetoleranz"><span id="K.C3.A4ltetoleranz"></span>Kältetoleranz</h2></div>

<p>Bei der wissenschaftlichen Beschreibung dieser Art wurde ein spezielles Augenmerk auf die physiologischen Mechanismen der Kältetoleranz (Psychrophilie) gelegt.

</p><p>Genetische Untersuchungen zeigten, dass <i>Flavobacterium bomense</i> <a href="Gen" title="Gen">Gene</a> für Proteorhodopsin (PR) besitzt. Proteorhodopsin ist eine lichtabhängige Protonenpumpe von

Bakterien, die Licht zur Produktion von ATP nutzen kann (ähnlich wie bei der <a href="Photosynthese" title="Photosynthese">Photosynthese</a>). Es kann die Wachstumsrate einiger Arten verbessern, allerdings ist das nicht immer der Fall. Proteorhodopsin kann man als eine physiologische Anpassung von Bakterien an Stressbedingungen betrachten. Die PR-Gene können somit vorteilhaft für das Überleben von Flavobacterium-Bakterien in kalter und nährstoffarmer Umgebung sein.

</p><p>Als Kälteschutzmittel für Bakterien in marinen oder anderen kalten Umgebungen können Extrazelluläre Polysaccharide (EPSs), also außerhalb der Zelle angelagerte, langkettige Zuckermoleküle, genutzt werden. Alle getesteten Stämme von <i>Flavobacterium bomense</i> enthielten Genkopien von <i>lptA</i>, <i>lptB</i>, <i>lptC</i>, <i>lptF</i> und <i>lptG</i>. Diese Gene sind mit dem Transport von Polysacchariden aus der <a href="Membran" title="Membran">Membran</a> nach außen verbunden. Dies lässt vermuten, dass <i>Flavobacterium bomense</i> EPSs produzieren und nach außen exportieren kann, um die Zellen gegen niedrige Temperaturen zu schützen.

</p><p>Eisbindende Proteine (englisch Ice-binding proteins, IBPs) hemmen das Wachstum von <a href="Eiskristall" class="mw-redirect" title="Eiskristall">Eiskristallen</a> innerhalb und außerhalb der Zellen. Dadurch können Schädigungen durch Temperaturen unter Null Grad verhindert werden. Im <a href="Genom" title="Genom">Genom</a> von <i>Flavobacterium bomense</i> wurde ein Gen für IBPs gefunden. Gene für IBP wurden auch bei <i>Colwellia</i> sp. SLW05 und <i>Psychroflexux torquis</i> u. a. Arten nachgewiesen.

</p><p><a href="Sigma-Faktoren" title="Sigma-Faktoren">Sigma-Faktoren</a> (σ-Faktoren) sind bestimmte <a href="Protein" title="Protein">Proteine</a>, die für die <a href="Transkription_(Biologie)" title="Transkription (Biologie)">Transkription</a> bestimmter Gene verantwortlich sind. Es gibt mehrere verschiedene Sigma-Faktoren, wobei einige auch die Transkription von bestimmten Genen für Stressreaktionen steuern. Hierzu zählt z. B. Sigma-70 (σ<sup>70</sup>). Das Sigma-70 Gen (<i>rpoD</i>) erhöht auch die Resistenz gegenüber Kältestress bei psychrophilen Bakterien. In den Stämmen von <i>Flavobacterium bomense</i> wurde <i>rpoD</i> und auch <i>rpoE</i> gefunden. Letzteres ist mit der Reaktion auf Hitze und anderen Stresssituationen der Zellmembran und periplasmatischen Proteine verbunden.

</p><p>In kalten Umgebungen steigt die Bildung von Sauerstoffradikale, auch als <a href="Reaktive_Sauerstoffspezies" title="Reaktive Sauerstoffspezies">reaktive Sauerstoffspezies</a> (englisch: <i>reactive oxygen species</i>, ROS) bezeichnet. Psychrophile Bakterien produzieren zum Schutz vor den Sauerstoffradikalen bestimmte Proteine. Hierzu sind mehrere Gene bekannt, wovon einige auch bei <i>Flavobacterium bomense</i> gefunden wurden.

</p><p>Es wurden noch weitere Prozesse der Kälteresistenz bei <i>Flavobacterium bomense</i> untersucht, u. a. wurden Gene für <i>cold-shock-inducible proteins</i> (<i>cspA</i>), <i>ribosome-binding factor A</i> (<i>rbfA</i>), <i>translation initiation factors</i> IF-1 und IF-2 (<i>infA</i>, <i>infB</i>), <i>polynucleotide phosphorylase</i> (<i>pnp</i>) und <i>transcription termination protein A</i> (<i>nusA</i>) isoliert. Das Bakterium besitzt weiterhin die Gene für die Biosynthese von <a href="Carotinoide" title="Carotinoide">Carotinoiden</a>, Pigmenten, die dem UV-Schutz dienen. Außerdem wurden Gene für die Bildung von <a href="Glycogen" class="mw-redirect" title="Glycogen">Glycogen</a> und <a href="Prolin" title="Prolin">Prolin</a> sowie weitere für psychrophile Bakterien typische Gene gefunden.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Chemotaxonomische_Merkmale">Chemotaxonomische Merkmale</h2></div>

<p>Die häufigsten in der Zelle vorkommenden Fettsäuren sind <i>anteiso</i>-C<sub>15:0</sub> (<i>anteiso</i>-Pentadecansäure, <a href="Nomenklatur_(Chemie)" title="Nomenklatur (Chemie)">systematischer Name</a>: 12-Methyltetradecansäure) und iso-C<sub>15:0</sub> (<i>iso</i>-Pentadecansäure, 13-Methyltetradecansäure). Die häufigsten Hydroxyfettsäuren sind <i>iso</i>-C<sub>15:0</sub>-OH, iso C16:0 3-OH und iso C17:0 3-OH. Auch C<sub>16:ω7c</sub> (<a href="Palmitoleins%C3%A4ure" title="Palmitoleinsäure">Palmitoleinsäure</a>, cis-Hexadec-9-ensäure) und / oder C<sub>16:1</sub>ω6C und einige andere sind in geringen Mengen in der Zelle vorhanden. Das wichtigste polare <a href="Lipide" title="Lipide">Lipid</a> ist <a href="Phosphatidylethanolamin" class="mw-redirect" title="Phosphatidylethanolamin">Phosphatidylethanolamin</a>. <a href="Menachinon" title="Menachinon">Menachinon</a> 6 (MK-6) ist das einzige <a href="Chinon" title="Chinon">Chinon</a>, dies ist für alle Arten von <i>Flavobacterium</i> typisch. Der <a href="GC-Gehalt" title="GC-Gehalt">GC-Gehalt</a>, also der Anteil der <a href="Nukleinbasen" title="Nukleinbasen">Nukleinbasen</a> von <a href="Guanin" title="Guanin">Guanin</a> und <a href="Cytosin" title="Cytosin">Cytosin</a> innerhalb <a href="Desoxyribonukleins%C3%A4ure" title="Desoxyribonukleinsäure">DNS</a> beträgt 34,9-35,1 Mol-%.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Systematik">Systematik</h2></div>

<p>Die Art <i>Flavobacterium bomense</i> wurde im Jahr 2019 erstbeschrieben. Zuerst wurde sie <i>Flavobacterium bomensis</i> genannt, der Name wurde aufgrund der Bestimmungen der Namensgebungen von Bakterien geändert.<sup id="cite_ref-lpsn_1-0" class="reference"><a href="#cite_note-lpsn-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> <i>Flavobacterium bomense</i> zählt zu der <a href="Familie_(Biologie)" title="Familie (Biologie)">Familie</a> der <a href="Flavobacteriaceae" title="Flavobacteriaceae">Flavobacteriaceae</a>, welche wiederum zu der Ordnung der <a href="Flavobacteriales" title="Flavobacteriales">Flavobacteriales</a> gestellt wird. Sie zählt zum <a href="Stamm_(Biologie)#Als_taxonomische_Rangstufe_bei_Eukaryoten" title="Stamm (Biologie)">Stamm</a> (<a href="Phylum" class="mw-redirect" title="Phylum">Phylum</a>) <a href="Bacteroidetes" class="mw-redirect" title="Bacteroidetes">Bacteroidetes</a>.<sup id="cite_ref-lpsn_1-1" class="reference"><a href="#cite_note-lpsn-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Einzelnachweise">Einzelnachweise</h2></div>

<a rel="nofollow" class="external text" href="https://lpsn.dsmz.de/species/flavobacterium-bomense">Species <i>Flavobacterium bomense</i></a> In: <i><a href="List_of_Prokaryotic_names_with_Standing_in_Nomenclature" title="List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature">List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature</a> (LPSN)</i>. Abgerufen am 7. November 2020.</span>

</li>

</ol>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Literatur">Literatur</h2></div>

<ul><li>Qing Liu, Hong-Can Liu, Yu-Guang Zhou und Yu-Hua Xi: <i>Microevolution and Adaptive Strategy of Psychrophilic Species Flavobacterium bomense sp. nov. Isolated From Glaciers</i> In: <i>Frontiers in Microbiology</i>, 22. Mai 2019, Band 10, S. 1069. <a href="https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.01069" class="extiw external" title="doi:10.3389/fmicb.2019.01069">doi:10.3389/fmicb.2019.01069</a>.</li></ul></div><div><div class="zim-footer">

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